Обеззаразяване на почвата в зеленчуковата градина се налага тогава, когато площта е много малка и всяка година едни и същи растения се отглеждат на едно и също място. Това довежда до натрупване на много зараза, която често компрометира реколтата.

Подготовката започва още през есента, като се събират всички растителни отпадъци и се изгарят. След това се извършва дълбоко обръщане на почвата, за да може тя да бъде изложена през цялата зима на студовете с цел възстановяването на структурата на почвата.

Възможностите за използване на химически препарати са ограничени в сравнение с оранжерии и парници поради големината на терена.

В малката градина за обеззаразяване е най-лесно да се използват син камък или хлорна вар.