Най-податливи към ротавирусна диария са прасилата от свине-първескини и прасетата в новосформирани групи с нестабилен имунитет.
Особено критичен е периодът между втората и шестата седмица. По това време прасетата са най-уязвими, защото пасивният имунитет е отслабен, а активният все още не е развит.
Ротавирусът навлиза в прасенцата през устата чрез контакт със замърсени млечни жлези и заразени фекалии за свине: 1 г изпражнения може да съдържа до 10 млн. вирусни частици и инфекциозната доца може да бъде много ниска – само 90 частици.
Вирусът се запазва до 9 месеца в околната среда.
В стомашно-чревния тракт прасенцата вирусът се възпроизвежда в клетките на епитела на тънките черва и той дегенерира. Това води до нарушаване на усвоямостта на хранителни вещества, а патогените, които са част от микрофлората на стомашно-чревния тракт на прасетата (напр. Е. Coli), по-лесно проникват в чревните стени.
Това усложнява хода на заболяването и често причинява смъртта на животните от вторична инфекция. В червата се развива диария поради възпалителни процеси, поради което прасенцата се обезводняват.
Фактът, че животните не могат да усвоят храната, причинява недостиг на енергия и хипотермия. Този симптомен комплекс води до смъртта на животното.
По-големите прасенца са по-податливи на вторични бактериални инфекции.