В семената на доматите се запазват някои блести като бактерийно изсъхване, бактериен пригор, бактерийно струпясване и тютюневомозаичен вирус. Обеззаразяването може се направи по няколко начина:

С 2%-ов разтвор от солна киселина. За целта семената от доматите се покриват с разтвора и се оставят 24 часа, като се разбъркват от време на време.

Обеззаразяване преди засяването на семената може да се направи с 2%-ов разтвор от солна киселина с накисване от 1 до 3 часа.

С оцетна киселина 0,6-0,8%-ов разтвор с накисване за 24 часа или полумокро обеззаразяване.

С 2%-ов разтвор от натриева основа с накисване за 60 минути.

Срещу тютюневата мозайка може да се използва 10%-ов разтвор от тринатриев фосфат, в който семената се накисват за 20 минути.

След обеззаразяването семената трябва да се изсушат и да се приберат на сухо място.