Дезинфекцията на кората на овощните дървета се препоръчва да се направи, когато преди това тя е почистена.

Най-лесно това става с 1%-ов бордолезов разтвор. Третирането се провежда в сухо време, като дървото се опръсква добре, но без капките да се стичат. Може да се използва и железен сулфат.

Дезинфекция на кората се извършва и при резитбата на дебели клони с диаметър по-голям от 3-4 см, както и при повреда на кората от измръзване, гризачи, отчесвания и други. Налага се заради направените рани, които представляват отвори за проникване на вода, инфектиране и загниване на тъканите. Ето защо всички отрези и други рани задължително се замазват с овощарски мехлем.